Hola! Estuvimos revisando tu situación un momento, y en resumen se complica hacer lo que solicitas debido a que las jerarquías vacías cuentan con jerarquías inferiores (Hub Name) lo cual al estar ocultando o filtrando esas jerarquías estarían ocultando también las jerarquías inferiores y sus valores.

Actualmente la tabla matriz tampoco deja utilizar formato condicional para las jerarquías. 

Estaba pensando en hacer una combinación de columnas condicionales en conjunto con crear tablas de dimensión para aplicar fórmulas cuando no hay valores en ciertas columnas, aunque podría hacer más complicado el mantenimiento de las visualizaciones en cuestión. Me refiero a algo similar a lo que se hace en esta clase: https://www.datdata.com/cursos/especializacion-en-dax-con-power-bi-dax101/clases/38---modelar-estados-financieros-desde-cero-5BIrpn


Tal vez podrías probar combinando las columnas de Región y ambas categorías, o solo las de categorías. O en su defecto rellenar con algo por defecto las columnas con celdas vacías.

Quedo atento.
Javier